Olha, se você usar um módulo DC-DC para o arduino e outro separado para o drive do motor, vai dar certo, porém aí é que entra a jogada, use um diodo para dividir a entrada sepando os dois, com o diodo o drive do motor não usará a corrente do módulo do arduino. É bem simples.

Look, if you use a DC-DC module for the Arduino and a separate one for the motor drive, it will work, but that's where the move comes in: use a diode to divide the input between the two, with the diode the drive the motor will not use the current from the Arduino module. It's quite simple.